José Rui Teixeira tem colaborado com centros de investigação, cátedras e institutos, integrando projetos, pronunciando conferências e publicando uma ensaística que coloca em diálogo as suas áreas de formação e interesse científico: teologia, filosofia, literatura e arte, antropologia e história da cultura e das religiões.
O seu trabalho incide particularmente na história da cultura portuguesa, no comparativismo, na hermenêutica literária e nas relações entre poesia e transcendência, particularmente no contexto finissecular: das tendências romântica, simbolista e neogarrettiana, às expressões neorromânticas saudosista e lusitanista [nas conjunturas histórico-culturais do Saudosismo e do Integralismo Lusitano]. Importa destacar o seu trabalho no âmbito da hermenêutica da poesia portuguesa contemporânea, assim como o seu contributo no âmbito dos estudos iberistas.
Recentemente, tem desenvolvido investigação específica sobre o meio literário portuense no século XIX, em torno da vida e da obra de Guilherme Braga, e sobre o diálogo intercultural entre Portugal e o Japão, no contexto da figura de Pedro Gastão mesnier.
José Rui Teixeira trabalha fundamentalmente três linhas de investigação:
MEMORIAL surgiu em 2006, em torno da vida e da obra de Guilherme de Faria. Dedica-se à recuperação, identificação e transcrição de documentos do espólio do poeta, assim como à reedição e divulgação da sua poesia. Desde 2013, este projeto foi integrando outros poetas, entre os quais se destacam poetas referenciais como António Nobre, Teixeira de Pascoaes, mas também figuras como José Bruges d’Oliveira, António Hartwich Nunes e António Pedro.
TEOTOPIAS surgiu em 2019, com o propósito de desenvolver projetos no âmbito das intersecções da literatura e da teologia. Organiza um colóquio bienal na UCP Porto, em parceria com a Cátedra Poesia e Transcendência e outras instituições de natureza académica e cultural; coordena/promove edições no âmbito das hermenêuticas do religioso nos espaços literários; estuda e divulga obras e autores que se situam interrogativamente diante da transcendência, nas suas múltiplas expressões.
FURUSATO é um projeto que nasceu em 2023, com o propósito de estudar as relações semiológicas e interculturais entre Portugal e o Japão, documentando e refletindo sobre as áreas de interseção, de encontro e de coabitação entre a literatura e a arte, a teologia e a história das religiões, a filosofia e a antropologia cultural, e interrogando os processos de representação e significação da cultura japonesa e do japonismo nas circunstâncias endógenas e exógenas das construções antropológicas e literárias.